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    【2022大創招募】徐鵬課題組——基于深度學習算法的大黃魚"內臟白點病"感染表型測定

    時間:2022/07/05

    來源:徐鵬課題組

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    課題簡介:

    由變形假單胞菌引起的“內臟白點病”是大黃魚養殖中的重要病害,具有極高的感染率和死亡率,對養殖產業構成重大威脅。目前我們已經將基因組技術運用在選育工作中,并取得了初步成效,但是目前我們還是采用感染后“死亡-存活”二分類性狀以及“死亡時間”作為抗性測評標準,反映的是大黃魚在感染后的耐受性指標。為了更加精確的表征大黃魚“內臟白點病”的抗性指標,我們引入深度學習((DL, Deep Learning)算法對脾臟“感染程度”表型進行標準化的測定。通過對大黃魚自然群體進行標準化的人工感染,收集感染高峰期的脾臟感染高質量圖片,并利用深度學習算法進行評估以確定每條大黃魚的感染程度,進一步優化我們的抗性表型標準化測量體系,以提高基因組選擇育種的預測準確性。

     

    招募人數:2人

    專業:海洋生物學

    任務要求:感染表型標注及分析工作

    聯系人:徐鵬老師,xupeng77@xmu.edu.cn


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